故事改编自真实事件，发生在17世纪位于意大利的一家修道院内。本尼蒂塔（维吉妮·艾菲拉VirginieEfira饰）出生在一个富裕而又虔诚的基督教家庭之中，在很小的时候，她就被父母送进了修道院深造，将她作为一名修女培养。在那个年代，进修道院对于一个女孩来说，是何等幸运的事情。一晃眼多年过去，贝尼蒂塔已经出落成为了大姑娘了，并且成为了修道院院长福利西塔（夏洛特·兰普林CharlotteRampling饰）的得力助手。某日，一个衣衫褴褛的女孩冲进修道院求助，她的名字叫巴托洛梅阿（达芙妮·帕塔基亚DaphnePatakia饰），在本尼蒂塔的帮助之下，这个可怜的，遭受了父亲和哥哥虐待的女孩进入了修道院，成为了见习修女。可是，巴托洛梅阿就像一匹野马一样的难以驯服和管教，她的出现很快就让本尼蒂塔感到棘手和难以招架。

在 17 世纪的意大利佩夏，年轻的贝内黛塔·卡利尼 (Benedetta Carlini)被她的父母录取进入修道院院长费利西塔 (Felicita) 经营的Theatine修道院，成为一名修女。十八年后，贝内黛塔在戏剧中扮演圣母玛利亚时，看到耶稣在召唤她。有一天，一位名叫巴托洛梅亚的年轻农妇来到修道院寻求庇护，躲避虐待她的父亲。贝内黛塔被指派负责监督巴托洛梅亚融入修道院生活。那天晚上，巴托洛梅亚亲吻了贝内黛塔。

贝内黛塔开始反复出现耶稣的异象。在经历了一次特别令人担忧的幻象后，贝内黛塔误认为一个男人救了她免遭轮奸，之后她陷入了重病。费利西塔女修道院院长指派巴托洛梅亚照顾她。贝内黛塔看到了基督的另一个异象，要求她脱掉衣服并触摸他的手。第二天早上，她醒来时手掌和脚上都 出现了伤痕。

随后进行了调查。费莉西塔女修道院院长对此表示怀疑，因为贝内黛塔的圣痕是在她睡觉时而非祈祷时显现的，而且她的额头上也没有荆棘王冠的痕迹。在费利西塔的房间外，贝内黛塔倒下了。然后她开始用愤怒的男性声音说话，严厉斥责那些怀疑她的人，同时她的额头上出现了流血的伤口。费利西塔的女儿克里斯蒂娜修女在发现附近的陶器碎片后怀疑贝内黛塔的伤口是自己造成的。

在费利西塔和当地教会领袖就如何处理民众对贝内黛塔异象的兴趣发生争执后，贝内德塔被提升为女修道院院长，取代费利西塔。贝内德塔和巴托洛梅亚搬进了费利西塔的旧住所并开始了性关系，后来使用了巴托洛梅亚用贝内德塔的木制圣母玛利亚雕像雕刻的 假阳具。

在忏悔中，克里斯蒂娜向神父撒谎说她亲眼目睹贝内黛塔额头上受伤。第二天，神父强迫克里斯蒂娜公开说出她的指控。当神父询问时，费利西塔反驳了克里斯蒂娜的说法，因为克里斯蒂娜此前曾向她承认，她实际上并没有看到伤口是自己造成的。贝内黛塔显然被耶稣的灵魂附身，命令克里斯蒂娜鞭打自己。费莉西塔后来通过房间里的窥视孔观察到贝内黛塔和巴托洛梅亚发生性关系。

克里斯蒂娜感到羞辱，从修道院的屋顶跳下身亡。当瘟疫开始肆虐乡村时，贝内德塔预感到佩西亚将幸免于难，并下令关闭修道院以防止感染。费利西塔秘密前往佛罗伦萨，向当地教皇大使报告贝内黛塔的性行为不端行为。与此同时，贝内黛塔突然去世，原因不明。

费利西塔与大使一起返回修道院后不久，贝内黛塔苏醒过来，说她在天堂，看到了在场所有人的命运。大使作为教皇的代表，成立了一个法庭对贝内德塔的行为进行调查。巴托洛梅亚最初否认与贝内德塔有任何性关系，但在受到大使手下的酷刑后，她最终承认了真相，并带领大使找到了隐藏在圣经中的木制假阳具。他逮捕了贝内黛塔；她再次用男性声音猛烈抨击那些迫害她的人，并宣布大使很快就会生病。大使发现费莉西塔感染了鼠疫，并下令隐瞒她的病情。巴托洛梅亚被逐出修道院。

在城镇广场上，在被处决之前，贝内黛塔露出了新的圣痕，并用男性声音宣布死亡天使即将来临。费莉西塔透露了自己的疾病，并指责大使将瘟疫带到了佩西亚。镇民阻止大使的手下将贝内黛塔烧死在火刑柱上，混乱随之而来。巴托洛米亚解开贝内黛塔，发现她脚下有一块血淋淋的陶片。大使被愤怒的暴徒杀害，贝内德塔和巴托洛梅亚逃离小镇，费利西塔在为处决贝内德塔而点燃的火上自焚。

在城外的一个废弃马厩中，与巴托洛梅亚共度一夜后，贝内黛塔坚持她必须返回修道院。巴托洛梅亚恳求她留下来，并试图让她承认她伪造了自己的耻辱，但贝内黛塔拒绝了，而是返回佩西亚。

一张标题卡显示，贝内黛塔一直住在修道院里，直到 70 岁去世，而瘟疫也让佩西亚幸免于难。